华西基础医学与法医学院发源于华西协合大学相关学科。华西协合大学是仿英国牛津大学体制、于1905年筹建的综合性大学，不仅学术起点高，而且为四川“保路运动”、抗日救亡运动、抗美援朝等做出过重要贡献。今天的华西基础医学与法医学院是由原华西医科大学基础医学院（1987年建院）和法医学院（1999年建院）于2001年7月合并组建。
华西基础医学与法医学院名师荟萃。华西协合大学创始人之一启尔德，华西协合大学创始人之一、解剖学家莫尔思，我国两栖爬行动物学主要奠基人、中国科学院学部委员刘承钊，我国生物化学学科创建人之一蓝天鹤，医学基础教育名师陈文贵、白英才、陆振山、王永贵、王浴生、薛振南、戴保民、高贤华，法医学专业奠基人吴家馼和吴梅筠等一代大师铸就了具有华西特色治学育人的昔日辉煌。学院现有在职教职员工近300人（含双聘双算、兼职博导）。拥有中国工程院院士1人（兼职博导），“国字号”高层次人才近30人次，国务院学科评议委员会特种医学组秘书长1人，教育部高等教育法医学专业教学指导委员会主任委员1人、秘书长1人，国家基础医学教学指导委员会委员1人，国务院学位委员会第八届学科评议组成员1人，国务院政府特殊津贴专家24人，四川省学术与技术带头人13人，四川省有突出贡献的优秀专家11人，省级教学名师2人，省级教书育人名师2人，研究生导师近80人（含兼职博导）。学院还有一批国家百千万人才工程一、二层次人选，四川省高层次人才计划入选者等国家级及省级杰出人才称号的师资队伍。
华西基础医学与法医学院英才辈出。基础医学专业是国家首批理科科学研究与人才培养基地，基础医学与法医学是教育部的特色专业，是国家级一流本科专业建设点，法医学专业全国软科排名A+。基础医学专业首批入选基础学科拔尖学生培养计划2.0基地、强基计划。基础医学是国家“双一流”建设学科，应激医学是四川大学超前部署建设学科，法医学和生物医学工程是国家重点学科。学院拥有国家级实验教学示范中心、国家级教学团队和国家级一流本科课程9门。承担四川大学临床医学、口腔医学、药学、公共卫生等全部医学学科和部分文理工学科的医学基础课教学工作，获得国家级、省级教学成果奖等十余项奖励。学院围绕一流创新人才培养目标，全面推进教育教学改革，为国家培养出了一大批优秀的专家学者和行业精英。
近5年，学院在Nat Genet、Nat Med、Nat Commun、Cell Metab、Cell Host Microbe、PNAS、Ann. Neurol等国际著名学术期刊发表高水平科研论文超过75篇，并获多项国家级、省部级科研奖励，为世界一流大学、一流学科的建设奠定了坚实的基础。学院将持续围绕肿瘤等慢性重大疾病、心脑血管重大疾病发病机制研究，重大传染病的监测、发病机制与防治研究，辐射损伤机制与诊疗新技术研究，法医复杂检材的溯源与表型研究，毒（品）物质检测技术与毒性作用机制研究及死亡与损伤的精准鉴识技术研究等领域开展原始创新前沿探索。
学院设有12个教研室（系），3个研究室，1个研究所，2个公共服务平台，1个四川大学国家级实验教学中心，1个挂靠单位（实验动物中心）。学院设有行政机关，下设党政办、学科办、教学科、学生科四个科室。
